Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r48E9Q5D8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn2r48E9Q5D8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn2r48E9Q5D8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms