Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3250E9Q1M3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3250E9Q1M3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3250E9Q1M3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3250E9Q1M3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms