Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3002E9PW72 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3002E9PW72 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3002E9PW72 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3002E9PW72 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms