Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc62E9PVD1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc62E9PVD1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms