Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc175E9PVB3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc175E9PVB3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc175E9PVB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc175E9PVB3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc175E9PVB3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc175E9PVB3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc175E9PVB3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc175E9PVB3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc175E9PVB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc175E9PVB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms