Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-2D3Z4R4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-2D3Z4R4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx6-2D3Z4R4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms