Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms