Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ythdc2B2RR83 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ythdc2B2RR83 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ythdc2B2RR83 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ythdc2B2RR83 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ythdc2B2RR83 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ythdc2B2RR83 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ythdc2B2RR83 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ythdc2B2RR83 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Ythdc2B2RR83 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ythdc2B2RR83 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ythdc2B2RR83 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ythdc2B2RR83 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ythdc2B2RR83 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ythdc2B2RR83 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ythdc2B2RR83 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ythdc2B2RR83 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms