Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf3B2RQG2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf3B2RQG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf3B2RQG2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms