Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cfap221A9Q751 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap221A9Q751 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap221A9Q751 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap221A9Q751 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms