Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3173A6NAS3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3173A6NAS3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3173A6NAS3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3173A6NAS3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms