Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r232A2RTT5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r232A2RTT5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r232A2RTT5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms