Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27,24■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27,23■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
GabreA2AMW3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27,18■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27,15■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27,14■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27,14■■□□□ 1,94
GabreA2AMW3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27,13■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27,11■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
GabreA2AMW3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,07■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,05■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27,02■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
GabreA2AMW3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26,98■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,97■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26,96■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
GabreA2AMW3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26,95■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
GabreA2AMW3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms