Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisal2aA2A9G7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal2aA2A9G7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal2aA2A9G7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms