Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbf1A2A870 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbf1A2A870 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbf1A2A870 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbf1A2A870 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbf1A2A870 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbf1A2A870 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbf1A2A870 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbf1A2A870 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbf1A2A870 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fbf1A2A870 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms