Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Akap17bA2A3V1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Akap17bA2A3V1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Akap17bA2A3V1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Akap17bA2A3V1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Akap17bA2A3V1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Akap17bA2A3V1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms