Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX7Q9UNH6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms