Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO4Q9UKT5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms