Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNL1Q9UK58 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL1Q9UK58 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms