Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLXNA1Q9UIW2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms