Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MIS18AQ9NYP9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MIS18AQ9NYP9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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