Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A12Q9NXJ0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms