Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMBRD1Q9NUN5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms