Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRKQ9NRH2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRKQ9NRH2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms