Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms