Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRIP1Q9BX63 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms