Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A9Q96Q91 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms