Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNBD2Q96M20 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms