Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM5Q71RC9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms