Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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