Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms