Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NANOGP8Q6NSW7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms