Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPW1

C11orf71, Uncharacterized protein C11orf71, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf71Q6IPW1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf71Q6IPW1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms