Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms