Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF212Q495C1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF212Q495C1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF212Q495C1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF212Q495C1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF212Q495C1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RNF212Q495C1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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RNF212Q495C1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF212Q495C1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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