Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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