Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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