Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms