Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRAF1Q13077 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRAF1Q13077 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRAF1Q13077 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRAF1Q13077 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRAF1Q13077 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRAF1Q13077 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRAF1Q13077 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRAF1Q13077 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TRAF1Q13077 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TRAF1Q13077 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TRAF1Q13077 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TRAF1Q13077 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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