Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms