Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms