Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms