Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms