Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPLO60437 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPLO60437 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPLO60437 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPLO60437 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PPLO60437 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPLO60437 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPLO60437 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPLO60437 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PPLO60437 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PPLO60437 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPLO60437 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPLO60437 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPLO60437 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPLO60437 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPLO60437 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPLO60437 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPLO60437 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PPLO60437 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms