Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF113AO15541 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms