Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATPIF1Q9UII2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATPIF1Q9UII2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms