Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFDP1Q9UEE9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms