Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms