Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms