Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMER3Q8N944 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMER3Q8N944 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms